根據環境監測系統的特性，子站運行周圍的環境對環境監測有一定的影響，因此應充分考慮到系統所處的地方環境和氣候對其產生的影響，相應的防塵、防雨、防盜作業等都應該有完備的設施與系統。

一般在環境監測系統的檢查中，首先要對各環境監測設備的運行狀態進行檢查和上報，還要進行每個子站的數據記錄與備份，有利于故障的系統記錄與排查。對具體的設備參數進行記錄、分析；檢查各設備周圍工作環境的情況，看是否處于正常的工作環境；如果發現環境監測過程中設備的參數與數據采集的異樣，或者在于其他子站的數據運輸中的異樣，應及時再次進行環境監測數據的調用并確定和排除具體故障。