環境監測系統中心站的預防性維護包括系統自身性能維護和中心站計算機遠程運行維護。通過中心站通過數據通訊軟件對各個子站的運行檢查是每日必做的維護工作，應正確的安裝和利用監測系統與通訊軟件，在保障通訊數據準確的前提下，對環境監測系統進行預防性維護。在雷雨季節，應加強防范環境監測系統的癱瘓與病毒入侵，及時通過遠程的方式進行環境監測數據的運輸性能的檢測，保證在特殊的天氣條件下中心站與各個子站的環境監測過程的正常運行。