經(jīng)過半個世紀的發(fā)展，我國的環(huán)境在線監(jiān)測技術雖然已經(jīng)相當成熟了，但依然存在一些問題，例如：

1.應急方面的監(jiān)測技術先進性不夠

目前我國在環(huán)境在線監(jiān)測上并沒有一套完整的應急技術系統(tǒng)，但很多指標都需要對現(xiàn)場進行快速、動態(tài)性的監(jiān)測，出現(xiàn)了較為嚴重的污染事件時現(xiàn)有的技術是無法滿足應急的需要。而且應急分析的成本較高，與發(fā)達國家相比，在設備的配置與系統(tǒng)建設上還存在著一定的差距。此外，目前所應用的應急儀器方法都不標準，而且大部分的監(jiān)測數(shù)據(jù)都是無法定量使用的。

2.監(jiān)測手段更新速度慢，現(xiàn)有的監(jiān)測方法不成體系

目前我國在空氣污染物的采樣及分析上并沒有形成系統(tǒng)的體系，而不同的污染物在監(jiān)測上所采用的分析方法也都是不同的。在具體的環(huán)境質(zhì)量監(jiān)測當中，在對每一個檢測項目進行監(jiān)測時，都要采取單獨對樣品采集、保存、處理與分析的方式，這樣就會導致現(xiàn)場樣品采集分析的難度加大，進而不利于監(jiān)測項目工作的開展。

3.監(jiān)測結果缺乏全面性

環(huán)境在線監(jiān)測技術是一種自動性的監(jiān)測技術，主要是通過多種監(jiān)測設備對污染的情況進行監(jiān)測與分析，然后將信息錄入到電子系統(tǒng)當中，其中監(jiān)測結果的不全面性就是一個比較明顯的表現(xiàn)，主要體現(xiàn)在每一個檢測點上監(jiān)測指標的制定較為單一。

4.管理制度尚不全面

環(huán)境在線監(jiān)測技術的順利實施必須要有完善的管理制度提供保證，保障在監(jiān)測過程中設備的高效、穩(wěn)定與安全進行。但是我國目前還沒有指定較為完善的管理制度，對于環(huán)境在線監(jiān)測技術的約束和管理力度也不強，尤其是在設備的維修與養(yǎng)護方面更是缺乏相應的管理制度，導致很多監(jiān)測設備處于閑置的狀態(tài)，造成了大量的資源浪費。