各種環境監測技術的應用發展使我國環境監測工作更進一步，特別是環境監測系統在我國很多地方的實際應用更是讓環保工作如虎添翼。然而，環境監測系統在應用實踐中，逐漸出現了一些不盡如人意的地方，亟待引起重視。

一是環境監測過程中管理力度有待提升。盡管環境監測系統依賴高科技的技術，實現了空氣質量實時監測，也極大提高了工作效率，可是，由于管理手段缺乏，管理人員的專業技術水平低下，不能及時發現和解決環境監測過程中出現的問題，導致環境監測管理力度跟不上，所得到的數據準確性差強人意，環境質量的真實信息無法反映出來，進而影響后續措施的制定。

二是體系不健全，不利于監測。雖然環境監測系統已經在我國多地投入運行，但卻沒有國家層面的統一質量監測體系，導致環境監測數據各地為陣，不能共享。同時，不少環境監測公司沒有建立相應的設備管理制度，致使一些較為先進的環境監測設備閑置，浪費了資源，這在一定程度上影響了環境監測效果。

三是環境監測方法和手段急需提高。目前，不少環境監測公司的專業技術人員相對缺乏，對環境監測設備的應用也差強人意，從而導致環境監測結果不能準確反映環境質量的真實信息，貽誤治理時機。還有，我國目前環境監測手段比較落后，跟不上發展，環境監測數據的準確性得不到保證，不能真實反映實時的環境質量。

如上所述，環境監測系統的應用還有一些不盡如人意的地方，但是隨著相關環境監測管理辦法和技術規范的完善，未來可期！